Evaluation of the MIB-producing potential based on real-time qPCR in drinking water reservoirs

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摘要

蓝藻会释放一种次级代谢产物——2-甲基异莰醇（MIB）。本研究提出了一种基于反转录定量实时PCR（RT-qPCR）的方法，通过检测MIB合成基因（mic）来评估水源中MIB的生成潜力。我们设计了一套MIBQSF/R引物，该引物基于12株纯培养的MIB产藻菌株的mic基因序列以及从NCBI数据库中获取的23个序列（共35个mic基因序列）构建而成。此引物成功识别了所有已知的43株MIB产蓝藻菌株（包括本研究中的12株和NCBI数据库中的31株），这些菌株隶属于不同的属，其覆盖范围比现有的引物组更广。该方法的效率通过以下指标得到了验证：扩增效率（E = 91.23%）、标准曲线的R²值（0.999）、检测限（LOD，5.7 fg μL⁻¹）以及定量限（LOQ，1.86 × 10⁴基因拷贝μL⁻¹）。此外，该方法还通过分析50个来自不同水库的野外样本（R² = 0.614，p < 0.001）以及单一水库样本（R² = 0.752，p < 0.001）中mic基因丰度与MIB浓度之间的相关性进行了验证，表明该方法具有作为替代预警工具的潜力，可用于评估水源中MIB问题的风险。

引用

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@Article{suruzzaman2022evaluation,
    title       = {Evaluation of the {MIB}-producing potential based on real-time qPCR in drinking water reservoirs},
    author      = {Md Suruzzaman and Tengxin Cao and Jinping Lu and Yongjing Wang and Ming Su and Min Yang},
    year        = 2022,
    journal     = {Environmental Research},
    pages       = 112308,
    url         = {https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0013935121016091},
    doi         = {10.1016/j.envres.2021.112308}
}